بررسی عامل ارثی صرع غیر سندرمی اتوزومی مغلوب در یک خانواده ی ایرانی به روش توالی یابی کامل اگزوم

مقدمه: علت بیشتر موارد صرع ناشناخته است و عوامل ارثی می تواند در بروز آن نقش داشته باشد. امروزه، تحقیقات وسیعی در زمینه ی علل ایجاد صرع در حال انجام است. هدف از انجام این مطالعه، شناسایی ژن (های) عامل صرع غیر سندرمی با الگوی توارث اتوزومی مغلوب در یک خانواده ی ایرانی به روش توالی یابی کامل اگزوم بود. روش ها: مطالعه ی حاضر، از نوع تجربی بود. dna ژنومی از خون سه فرد مبتلا و یکی از افراد سالم خانواده، استخراج و توالی یابی اگزوم با پلت فورم illumina hiseq 2000 انجام شد. ابتدا، دسته بندی واریانت ها از نظر نوع، جایگاه جهش و فراوانی آللی و سپس، اولویت بندی آن ها با دو رویکرد انجام شد. توالی یابی سنگر برای تأیید واریانت nm_207111.3(rnf216): (g.5780794g>a), (c.854c>t) ژن rnf216 انجام شد. یافته ها: از 130855 واریانت، حدود 85 درصد از نوع تغییرات تک نوکلئوتیدی و 15 درصد از نوع indels بودند. یک سوم تغییرات در نواحی بین ژنی و اینترونی، یک سوم در 3’,5’utr و یک سوم در نواحی اگزونی و جایگاه پیرایش بودند. از نظر فراوانی آللی در پایگاه داده ی exac و 1000 ژنوم، به ترتیب 8/3 درصد و 4/3 درصد واریانت ها، فراوانی آللی کمتر از 01/0 داشتند. با اعمال هر دو رویکرد، واریانت nm_207111.3(rnf216): (g.5780794g>a), (c.854c>t) ژن rnf216 به عنوان کاندیدا شناسایی شد، اما ارتباط این واریانت در همه ی اعضای خانواده تأیید نگردید. نتیجه گیری: توالی یابی اگزوم به ابزاری جهت مطالعه ی عوامل ژنتیکی بیماری های مندلی تبدیل شد، اما با محدودیت هایی نیز همراه بود. در صورت قرار گرفتن واریانت در نواحی غیر کد شونده ی ژنوم، هتروژنی کلینیکی، تشخیص نادرست بیماری، فنوکپی، محدودیت های تکنیکی و آنالیز واریانتی، می توانند موانعی برای شناسایی واریانت عامل بیماری محسوب شوند که باعث عدم موفقیت در شناسایی ژن عامل بیماری در این خانواده شده اند.